確かCS4からの機能で「レイヤーを自動合成」の「画像をスタック」を試してみました
これは、ピントのあったところだけを自動的に一枚にまとめてくれるものです
まずは被写界深度の浅いフォーカス位置の異なる10枚の画像を用意して一つの画像にレイヤーとしてまとめます

すべてのレイヤーを選択して、「編集」〜「レイヤーを自動合成」〜「画像をスタック」を選択.....後は待つだけ!
あくまでもテストなので軽い画像を用意したんですが、10枚もの画像だけあって処理には結構時間がかかります

料理撮影のような深い被写界深度が必要な場合にでも回折の影響を気にしなくても良さそうです